В мае 1984 года на базе книжного отдела был создан отдел редких книг Государственной библиотеки. С 1 июля того же года этот отдел начал работать самостоятельно. Фонд отдела (около 68 тыс. изданий, из них более 17 тыс. — книги, остальное — периодические издания, диссертации). В фонде отдела хранятся редкие издания краеведческого характера, которые сочетают в себе историческую, научную и культурную ценность для изучения истории книги и книгопечатания Туркменистана. Также в фонде отдела хранятся издания, имеющие большую ценность в науке, культуре, в том числе подаренные писателями и поэтами не только Туркменистана, но и других стран. В отделе редких книг, книги не только на туркменском и русском языках, но и на европейских языках: английском, немецком, латинском, французском, итальянском, испанском, шведском, и восточных языках: арабском, персидском, турецком. Отдел редких изданий обслуживает читателей из собственного фонда, оказывает им консультативную помощь, предоставляет письменную и устную информацию, пополняет каталоги и картотеки новыми сведениями о Туркменистане, отбирает издания, содержащие ценные сведения по изучению страны. Сотрудники отдела также ведут общественную деятельность, организуют выставки, проводят библиотечные обзоры и интервью на месте и в библиотеке, регулярно пропагандируют издания отдела в средствах массовой информации .
